此前,本片定名为《变种大乱斗》。很显然,在影片中,变种动物显然不止神龟一种。此外,这一版的《忍者神龟》将会“突出神龟们的少年属性”。影片改编自幻影工作室1984年发行的漫画,主要讲述了在纽约市一条大街的地下管道里住着四只功夫高强的忍者神龟和他们的老师斯普林特。这四只神勇无比、神气十足的小乌龟,手执忍者刀、武士棒、双截棍和钢叉,披挂上阵英勇迎敌,团结如兄弟,不畏邪恶与恐吓,始终与妖魔鬼怪斗争。片段从意大利罗马开始,我们看到海莉·阿特韦尔饰演的格蕾丝正在接受意大利当局的审讯。然后,我们看到她与汤姆·克鲁斯饰演的伊森·亨特在一个房间里,我们了解到她是一个盗窃高手,被一个神秘客户派去偷一把很多人都在找的钥匙。